השילוב של נושא האבולוציה בתוכנית הלימודים בחטיבת הביניים מציב אתגרים להוראה, ביניהם מיעוט חומרי הלימוד בתחום, הקושי בהוראת נושא חדש והצורך להתאימו לתוכנית הלימודים השוטפת.
התיאוריה של צ'רלס דרווין על הברירה הטבעית ומוצא המינים נחשבת אחת מהתרומות החדשניות והחשובות ביותר של המדע המודרני. עם זאת, כשהועלתה לראשונה בשנת 1859 היא עוררה סערה בקהילה המדעית ונדחתה